法律分析：根据一直以来的交易习惯，开票就可以了。法律依据：《中华人民共和国发票管理办法》第十九条 销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票；特殊情况下，由付款方向收款方开具发票。
委托加工的开票流程如下：确定发票种类：委托加工需要开具增值税专用发票。如果双方约定开具其他种类的发票，也可以根据约定进行开具。确定开票金额：根据委托加工合同约定的金额或者实际发生的金额进行开票。收集相关资料：包括委托加工合同、委托方和加工方的纳税人识别号、地址、电话等相关信息。
你这种情况很常见，你推销的价格比医药公司低，说明你从你的代理费中让利给药房了，你可以让医药公司按你给药房的价格开发票（要是按医药公司的价格开会多交税），然后在与医药公司结算代理费的时候，将这部分让利（差价）扣出来就行了。
要开增值税专用发票的，货物或应税劳务名称填写：加工费，然后根据合同价款填写金额。增值税不存在委托方出的问题，把加工费除以1+17%就是入账的加工费，再乘以17%就是应缴纳的增值税。委托加工当中，委托方不需向受托方就材料开具增值税发票，而是应由受托方向委托方就加工费开具增值税发票。
你的情况就是只收取手续费，委托方可以直接开票给受托方，受托方按收取的手续费给委托方开机普通发票。但受托方与客户签订的合同有说法：受托方与客户可以签订代销合同，货物供应方为委托销售单位，三方盖章生效。受托方直接以委托方的名义与客户签订合同，合同双方为委托方和客户。
《药品流通监督管理办法》第九条规定：“药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。
药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。
生产企业的生产许可证本身就可以销售自己的产品。生产企业同时可以申请经营许可证（需要具备经营条件），有了经营许可证就可以经营在经营范围内的产品，包括其他企业的商品。分公司的设立另有规定。
如果只获得GMP认证，应该是药品生产企业，根据上述规定，该药品生产企业可以将本企业生产的药品销售给具有合法资质的药品经营和使用单位（即具有《药品经营许可证》和《医疗机构执业许可证》的单位）。提问所涉及的“零食终端”如有具有合法药品经营使用资质，是可以销售的，否则不得销售。
第九条 药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。
1、药品流通管理办法会对药品的购销有规定因为：药品是一种特殊的商品，使用药品不当或者使用假劣药品可能会给人体健康带来极大危害，所以国家对药品的生产、流通、销售都实行了严格的管理和监管。
2、在药品流通环节，国家加强对药品经营企业的监管，要求企业建立健全药品追溯体系，确保药品流通的透明度和可追溯性。此外，国家还推行了药品电子监管码制度，对药品流通进行实时监控和管理。药品销售环节的监管 药品销售环节也是国家药品监管的重点之一。
3、原因：为严厉打击药品经营中的违法违规行为，全面规范各省药品流通秩序。
4、该法规共分为六章，包括了药品流通的各个环节，如药品生产、经营、储存、运输、销售等，对药品流通企业的资质、管理、监督等方面做出了详细规定。
5、第一条 为加强药品经营质量管理，规范药品经营行为，保障人体用药安全、有效，根据《中华人民共和国药品管理法》、《中华人民共和国药品管理法实施条例》，制定本规范。第二条 本规范是药品经营管理和质量控制的基本准则。
6、节省了医药公司传统营销的人力和物力成本，从源头上降低药价，降低控销品种对终端门店的批发价格，从而改进医药流通市场，让更多老百姓受益。控销，控制性销售的简称，控销模式通常是指终端控销，主要是通过控“四控”（控制价格、控制区域、控制渠道、控制终端）来实现产品销售的模式。
《药品流通监督管理办法》第九条规定：“药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。
药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。
《药品流通监督管理办法》（国家食品药品监督管理局令第26号）第九条规定：药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。第十三条规定：药品生产、经营企业知道或者应当知道他人从事无证生产、经营药品行为的，不得为其提供药品。
第八条 药品生产、经营企业不得在经药品监督管理部门核准的地址以外的场所储存或者现货销售药品。第九条 药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。
第七条 药品生产、经营企业应当加强对药品销售人员的管理，并对其销售行为作出具体规定。第八条 药品生产、经营企业不得在经药品监督管理部门核准的地址以外的场所储存或者现货销售药品。第九条 药品生产企业只能销售本企业生产的药品，不得销售本企业受委托生产的或者他人生产的药品。